More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6511 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  88.26 
 
 		 214 aa  334  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.61 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.58 
 
 		 222 aa  262  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.81 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.28 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.75 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  59.35 
 
 		 221 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.39 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  59.53 
 
 		 219 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  57.01 
 
 		 215 aa  237  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  60.28 
 
 		 221 aa  234  8e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1509  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 221 aa  234  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198395  normal  0.0597777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.53 
 
 		 224 aa  233  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  56.16 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.07 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 226 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.06 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  58.53 
 
 		 226 aa  225  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.67 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.14 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.21 
 
 		 261 aa  221  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 247 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.02 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.66 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.88 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.42 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  56.81 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.67 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.49 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 302 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.74 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.63 
 
 		 236 aa  204  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  55.35 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.2 
 
 		 217 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.56 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  50.93 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.97 
 
 		 234 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  53.99 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  51.87 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.24 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  55.14 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 232 aa  197  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 222 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.27 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  51.15 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  51.16 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  50.92 
 
 		 227 aa  194  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.61 
 
 		 226 aa  194  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.09 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 214 aa  194  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.64 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 230 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.4 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  49.3 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.64 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  44.96 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  50.46 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>