More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0303 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  88.26 
 
 		 215 aa  333  9e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.22 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.28 
 
 		 222 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.79 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.93 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.4 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.07 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.01 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.17 
 
 		 224 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.88 
 
 		 218 aa  238  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  61.86 
 
 		 221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.28 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  59.26 
 
 		 226 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  58.8 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  56.88 
 
 		 230 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  57.87 
 
 		 215 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.83 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.26 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 226 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1509  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 221 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198395  normal  0.0597777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.35 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.09 
 
 		 233 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.05 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.42 
 
 		 261 aa  220  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  58.41 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.35 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.74 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.34 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.05 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  54.46 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.09 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.09 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  50.67 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.4 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  52.56 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.79 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.13 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.8 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.05 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 221 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.95 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.13 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  52.51 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  51.63 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.21 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.22 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.54 
 
 		 229 aa  197  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  53.74 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  49.78 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.67 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.63 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  52.53 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.92 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 221 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  54.84 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.09 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 241 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  55.35 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  40.24 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.26 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 228 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  49.07 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.87 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  52.07 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>