More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0232 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  100 
 
 		 213 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.36 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  60.56 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.14 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.38 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.55 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  58.41 
 
 		 230 aa  228  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.8 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 230 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.75 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  57.08 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  56.48 
 
 		 226 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  54.76 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.13 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.71 
 
 		 230 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.97 
 
 		 215 aa  215  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.02 
 
 		 221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.4 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.08 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.46 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  53.17 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.95 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  51.89 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  52.66 
 
 		 216 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 213 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.08 
 
 		 218 aa  208  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  50.89 
 
 		 228 aa  207  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.98 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.13 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  52.63 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  52.11 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 224 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.55 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  50.72 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.13 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3222  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  52.34 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.89 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.81 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.67 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.18 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.48 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  50.95 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  54.29 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 225 aa  197  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.47 
 
 		 211 aa  197  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  50.48 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.98 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.89 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.7 
 
 		 261 aa  194  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  50.93 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.89 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.55 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.87 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.11 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.17 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.84 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  51.42 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.14 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  50.47 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 247 aa  191  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.85 
 
 		 233 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.78 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>