More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5265 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.83 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  60.65 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.1 
 
 		 222 aa  244  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  60.37 
 
 		 221 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 221 aa  243  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  60.83 
 
 		 221 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.45 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.87 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.39 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  58.99 
 
 		 215 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.01 
 
 		 217 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.34 
 
 		 226 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  56.76 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.55 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.86 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.8 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.48 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.68 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.75 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.38 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.45 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.96 
 
 		 215 aa  217  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  55.5 
 
 		 230 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.15 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.38 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.3 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 221 aa  211  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.7 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.88 
 
 		 222 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  54.42 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.58 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.61 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  54.34 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.82 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.68 
 
 		 222 aa  205  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.09 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 226 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1509  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.198395  normal  0.0597777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.02 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.25 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 226 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.39 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.29 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  39.92 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.89 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.17 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  52.78 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  48.13 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.92 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  47.25 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 214 aa  191  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.69 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50.24 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.92 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  50 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 234 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>