More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3748 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 236 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.86 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  62.16 
 
 		 223 aa  264  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  63.23 
 
 		 222 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.16 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.55 
 
 		 225 aa  252  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3727  two component LuxR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.82 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.27 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.81 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 224 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.35 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  59.91 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.45 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.73 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  59.45 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.99 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.56 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.96 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.55 
 
 		 224 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.48 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.27 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  58.06 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  55.16 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  56 
 
 		 226 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  56.74 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.78 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  56.25 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.45 
 
 		 218 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  52.97 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  55.66 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  54.79 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.34 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.31 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.4 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.47 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.75 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.36 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.94 
 
 		 227 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  54.13 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  51.38 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.33 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.67 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.85 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.25 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  54.09 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.66 
 
 		 230 aa  201  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.33 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.14 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  53.12 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  53.46 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.47 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.13 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.36 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  53.92 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.87 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.22 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  39.22 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.33 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.34 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.11 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.56 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  49.31 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  47.81 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.44 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.11 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 244 aa  191  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  44.03 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 302 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  49.54 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>