More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8799 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  100 
 
 		 227 aa  437  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  76.89 
 
 		 228 aa  318  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.69 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.51 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  67.13 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.88 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1603  two component LuxR family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.21 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.36 
 
 		 229 aa  228  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.09 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  59.17 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.33 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  61.79 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  54.63 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2268  two component LuxR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 250 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00478344  normal  0.0390494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  55.35 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.68 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00793239  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  54.63 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.35 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.09 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.89 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.79 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5068  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.65 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.91 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 219 aa  194  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  54.72 
 
 		 215 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.24 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.83 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0296  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.22 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.25 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.48 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.63 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.09 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  50.7 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.81 
 
 		 215 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 221 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.4 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.72 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.78 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.65 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  46.93 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.42 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.93 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2489  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.4 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.85 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0178  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.21 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  38.31 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.32 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.66 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  46.95 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  43.78 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.85 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  40.49 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  48.37 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  46.12 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>