More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4672 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  55.35 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  54.88 
 
 		 228 aa  214  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  51.17 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 222 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  50.92 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  54.38 
 
 		 217 aa  198  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1603  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  48.84 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.98 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2268  two component LuxR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00478344  normal  0.0390494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.29 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  45.54 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  46.51 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  48.83 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  45.66 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  46.01 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.8 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00793239  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  48.37 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.27 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.23 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 224 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.12 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.55 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.01 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 225 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.14 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.09 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.12 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.49 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.26 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.67 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  42.52 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4067  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.352272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>