More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3714 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 225 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.09 
 
 		 222 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.76 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  54.67 
 
 		 215 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  51.87 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  55 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.24 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.36 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.82 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  48.4 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.4 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.58 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.44 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.58 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  47.98 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.93 
 
 		 215 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 222 aa  188  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.8 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  50.47 
 
 		 216 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  53.3 
 
 		 213 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.14 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  51.15 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.36 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.38 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.51 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.69 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 230 aa  177  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  49.53 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.1 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.53 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.66 
 
 		 218 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5719  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  43.98 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.95 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1603  two component LuxR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  49.31 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>