More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2414 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.76 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.79 
 
 		 219 aa  225  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.8 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.53 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  47.73 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  48.66 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  46.95 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 232 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25020  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.58 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  48.4 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  47.91 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.93 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.44 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  48.86 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  46.05 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  47.12 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1603  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0395  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.87 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.32 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.42 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  43.38 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  44.86 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  42.79 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  43.46 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.13 
 
 		 302 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.58 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.2 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  43.26 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.46 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 208 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.84 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  45.75 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4995  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 228 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  41.28 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>