More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3696 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 217 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  71.3 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.91 
 
 		 220 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  68.06 
 
 		 218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.89 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.75 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.28 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.13 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.54 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  53.49 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.07 
 
 		 222 aa  194  8.000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  53.02 
 
 		 215 aa  185  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 215 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  47.44 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  48.37 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  51.61 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.29 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.95 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  46.51 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  49.54 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.93 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4857  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.93 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.243741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.61 
 
 		 239 aa  164  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  45.75 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  43.46 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  45.41 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.66 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  47.69 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  47.42 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25620  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.2 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.68 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 221 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 221 aa  161  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  42.33 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  48.86 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.42 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>