More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0508 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  100 
 
 		 212 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  76.3 
 
 		 206 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.26 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.14 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  55.24 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 213 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  48.57 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  44.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  44.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.83 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 226 aa  177  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  46.92 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 219 aa  175  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.83 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.57 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.4 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.82 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.51 
 
 		 229 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1618  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  41.75 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 222 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.61 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 250 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  46.23 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.13 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  45.71 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  48.13 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>