More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3219 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  68.57 
 
 		 218 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.39 
 
 		 232 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 215 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.07 
 
 		 217 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  54.77 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  56.34 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 213 aa  201  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 215 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.34 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.52 
 
 		 216 aa  194  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  50.46 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.21 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.3 
 
 		 215 aa  188  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.69 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.66 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  44.7 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  48.83 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  47 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  49.27 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.78 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  45.37 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.36 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  44.04 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  47.93 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  35.97 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  39.26 
 
 		 248 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  46.98 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  44.8 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.27 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.26 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23660  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.18 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  45.79 
 
 		 233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.18 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 228 aa  160  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.54 
 
 		 220 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  43.98 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.86 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.62 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.51 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  44.8 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.98 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 227 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.86 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  43.72 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>