More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3004 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  70 
 
 		 215 aa  298  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  68.64 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  61.75 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.91 
 
 		 216 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.93 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.36 
 
 		 213 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.72 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  59.91 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.72 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.87 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.99 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  55.25 
 
 		 218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.6 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.79 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  54.17 
 
 		 215 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.89 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.47 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  50.22 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.34 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 219 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.4 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.36 
 
 		 222 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  51.57 
 
 		 218 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 188 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.78 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.42 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.67 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 225 aa  192  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.34 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.43 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  48.87 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.05 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.2 
 
 		 226 aa  188  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.64 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.44 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.32 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.88 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.3 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.51 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.85 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.79 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.77 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  52.04 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.98 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.95 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  46.82 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 222 aa  181  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  47.53 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.4 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  48.65 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.45 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  47.98 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.49 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.86 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  48.18 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.87 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.09 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.37 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.09 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.11 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  40.08 
 
 		 248 aa  175  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  46.58 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>