More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5550 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.63 
 
 		 215 aa  294  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  71.63 
 
 		 216 aa  294  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.2 
 
 		 225 aa  276  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.33 
 
 		 216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.87 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.27 
 
 		 223 aa  254  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  58.99 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.11 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  56.68 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.96 
 
 		 215 aa  247  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.69 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.15 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 249 aa  242  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.96 
 
 		 215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  55.07 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1734  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.2 
 
 		 188 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 225 aa  205  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.45 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.87 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  51.85 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.61 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  48.6 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 247 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  48.13 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.66 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.89 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  49.54 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.23 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.1 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.98 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  46.3 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  48.58 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.52 
 
 		 261 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.69 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  48.11 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.42 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 221 aa  187  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  46.12 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  51.64 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.93 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0644  response regulator receiver domain protein  38 
 
 		 261 aa  184  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.520039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1009  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.62 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.25 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.61 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.46 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  40.5 
 
 		 248 aa  181  9.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  46.3 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.84 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>