More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2225 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 209 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  62.14 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.12 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  63.98 
 
 		 214 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.4 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.9 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  56.82 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 225 aa  215  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  56.62 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.55 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3222  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.77 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  54.25 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  57.6 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  54.85 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.08 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.97 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.17 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  52.31 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  50.93 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.42 
 
 		 226 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  51.63 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.61 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 230 aa  195  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.87 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.58 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6094  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.44 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634688  normal  0.121163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  50.23 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.18 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.14 
 
 		 239 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  54.25 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.4 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  52.11 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.39 
 
 		 227 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.27 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.16 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.43 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.83 
 
 		 226 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  55.35 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  53.92 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.71 
 
 		 239 aa  191  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  50 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.86 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.91 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.02 
 
 		 302 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.15 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.46 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  50 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.51 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  53.08 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  48.57 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.91 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.04 
 
 		 234 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  52.36 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.67 
 
 		 230 aa  185  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.45 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 247 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.36 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 225 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  50.94 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.79 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  41.42 
 
 		 248 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.62 
 
 		 230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.84 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.76 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.93 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.17 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>