More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  100 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.16 
 
 		 215 aa  295  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.53 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 230 aa  191  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.25 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.69 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1960  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  51.38 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  51.18 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.46 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  52.78 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.44 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 224 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  51.61 
 
 		 220 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  45.12 
 
 		 215 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  50.46 
 
 		 218 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.21 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.32 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.71 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.2 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  48.84 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  47.25 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  48.18 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.18 
 
 		 241 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.66 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  48.62 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 232 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.71 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2010  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.95 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  48.39 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.53 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.73 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  48.4 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 249 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0303  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.75 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.61 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.54 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  43.58 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.7 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.31 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.4 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.96 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.8 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.87 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.03 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  44.14 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.85 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.09 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4995  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.54 
 
 		 228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.92 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  44.5 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  44.29 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  45.66 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  47.71 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0647  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.62 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39200  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.92 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>