More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2171 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 217 aa  209  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  47.62 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  47.62 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  44.6 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.88 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  44.93 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  45.63 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  44.93 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  42.86 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  46.15 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.33 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  44.59 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  47.37 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  44.81 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  42.11 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.2 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 303 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  40.38 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  42.38 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  47.34 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  40.09 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  47.34 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 1648 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  42.08 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  42.08 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2246  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  39.56 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  45.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  45.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  45.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  45.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  45.89 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  41.9 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  40.57 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  41.83 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  41.83 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  41.83 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  41.83 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  41.83 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>