More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2998 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  92.02 
 
 		 226 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.66 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.36 
 
 		 218 aa  292  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  76.85 
 
 		 220 aa  292  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  75.35 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.9 
 
 		 217 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  67.77 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  66.51 
 
 		 212 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  66.51 
 
 		 212 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.6 
 
 		 223 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.84 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  65.28 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.84 
 
 		 226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  64.79 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.39 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.59 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  61.16 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.5 
 
 		 217 aa  252  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.96 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  66.37 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.22 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  63.56 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.87 
 
 		 228 aa  247  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1737  regulatory protein LuxR  60.62 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.72 
 
 		 227 aa  244  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.705317  normal  0.304873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  61.95 
 
 		 231 aa  244  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0915  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.18 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.27 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  45.07 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 231 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4304  response regulator receiver  42.66 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.894661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.19 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.99 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6596  two component LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.91 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.91 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  42.23 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4598  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.85 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  38.25 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0424  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0433  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  39.64 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.73 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.1 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  34.25 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.04 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  41 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  33.18 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  37.91 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  34.07 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>