More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0094 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 233 aa  460  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 225 aa  269  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.08 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  64.42 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  65.87 
 
 		 214 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  60.54 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  59.82 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 231 aa  251  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  60.09 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 211 aa  247  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  62.98 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.52 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.81 
 
 		 233 aa  241  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 216 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.57 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.74 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  56.42 
 
 		 216 aa  234  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  56.4 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.82 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  56.74 
 
 		 212 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 244 aa  231  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.08 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  56.13 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.35 
 
 		 209 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.75 
 
 		 214 aa  218  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.21 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.64 
 
 		 223 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.4 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.77 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 216 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  54.34 
 
 		 218 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  50.95 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.44 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.52 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.81 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.89 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 222 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  41.71 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  36.45 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  36.92 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  36.45 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 216 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.81 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 213 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  40.19 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  39.72 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.07 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  41.04 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>