More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4227 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 221 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  52.09 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  52.09 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 215 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.14 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  55.07 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.98 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  47.06 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  49.04 
 
 		 218 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.87 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 213 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  46.57 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  46.67 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  47.87 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 213 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  48.31 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  48.31 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  48.31 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  48.31 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.31 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  51.18 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  45.54 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  49.03 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  44.71 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.22 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.34 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44.24 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  47 
 
 		 241 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.14 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>