More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2780 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  56.48 
 
 		 216 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.81 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.74 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  58.22 
 
 		 215 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 214 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  40.19 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.06 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  42.65 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 215 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 213 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  42.33 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  41.4 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  41.86 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  40.65 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  41.98 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  38.32 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  41.4 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  45.67 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  39.52 
 
 		 210 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.91 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.72 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.96 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  37.67 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>