More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4516 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  73.95 
 
 		 215 aa  292  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.02 
 
 		 215 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.02 
 
 		 215 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.19 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  63.26 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  63.26 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  63.26 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  63.26 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 216 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  62.15 
 
 		 215 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  61.68 
 
 		 215 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 216 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  61.95 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 215 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 203 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  67.7 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  55.39 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  49.04 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.29 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 239 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  46.92 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  47.39 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  45.5 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1132  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0615  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2347  GerE family regulatory protein  49.76 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.925531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1047  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0853  LuxR family DNA-binding response regulator  49.29 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1818  LuxR family DNA-binding response regulator  49.29 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 219 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.27 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>