More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1402 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  56.46 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.94 
 
 		 210 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.46 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  55.5 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.54 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  47.85 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  47.85 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  47.85 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 216 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 218 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 215 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  45.93 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  45.45 
 
 		 282 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  42.11 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.86 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  40.67 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  48.79 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  42.31 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  40.67 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 455 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>