More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2093 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3163  two component LuxR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.932633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1561  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.29 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  41.67 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  43.14 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  42.65 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 213 aa  158  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  38.54 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  38.21 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 212 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  35.68 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 206 aa  148  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  40.67 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  147  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  35.55 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  37.38 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  38.21 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>