More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7047 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  78.5 
 
 		 215 aa  352  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  77.57 
 
 		 214 aa  344  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  74.88 
 
 		 282 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  74.41 
 
 		 215 aa  331  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 215 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 215 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  71.03 
 
 		 215 aa  327  8e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.02 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  71.03 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  70.62 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  71.03 
 
 		 215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 215 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  70.62 
 
 		 215 aa  320  7e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  71.09 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  71.09 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  71.09 
 
 		 215 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  71.23 
 
 		 216 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.84 
 
 		 216 aa  313  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 214 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 215 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 203 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.19 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.19 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  54.72 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0615  LuxR family DNA-binding response regulator  50.95 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2347  GerE family regulatory protein  50.95 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.925531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1047  LuxR family DNA-binding response regulator  50.95 
 
 		 212 aa  204  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1132  LuxR family DNA-binding response regulator  50.95 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1818  LuxR family DNA-binding response regulator  50.48 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0853  LuxR family DNA-binding response regulator  50.48 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  59.26 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  45.24 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1634  LuxR family DNA-binding response regulator  48.58 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  43.54 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 455 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>