More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1216 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  430  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.98 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  70.23 
 
 		 214 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  70.23 
 
 		 215 aa  294  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  91.67 
 
 		 209 aa  293  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 215 aa  291  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 215 aa  290  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.3 
 
 		 215 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.3 
 
 		 215 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.02 
 
 		 216 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  64.81 
 
 		 216 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  63.08 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  63.08 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  63.08 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  63.08 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  278  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  62.62 
 
 		 215 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  63.08 
 
 		 282 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  62.33 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  61.86 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  61.86 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  61.86 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  60 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  60.28 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0615  LuxR family DNA-binding response regulator  48.82 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1047  LuxR family DNA-binding response regulator  48.82 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2347  GerE family regulatory protein  48.82 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.925531  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1132  LuxR family DNA-binding response regulator  48.82 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1818  LuxR family DNA-binding response regulator  48.34 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0853  LuxR family DNA-binding response regulator  48.34 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 210 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.7 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  43.81 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  45.24 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  40.48 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  40 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1634  LuxR family DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>