More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5584 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  86.51 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  86.98 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  86.51 
 
 		 215 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  85.58 
 
 		 215 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  85.51 
 
 		 215 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  85.51 
 
 		 215 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  85.05 
 
 		 216 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  85.05 
 
 		 215 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  85.51 
 
 		 215 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  84.98 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  85.51 
 
 		 215 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  85.51 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  84.58 
 
 		 215 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  82.79 
 
 		 214 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  77.67 
 
 		 215 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  78.14 
 
 		 215 aa  350  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  79.07 
 
 		 215 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  79.91 
 
 		 215 aa  348  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  78.6 
 
 		 215 aa  347  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  78.6 
 
 		 215 aa  347  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  78.6 
 
 		 215 aa  347  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  73.02 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  69.16 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  69.16 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 215 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 214 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  66.98 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  68.81 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.86 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.86 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  61.4 
 
 		 215 aa  264  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 235 aa  234  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 218 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0615  LuxR family DNA-binding response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26011  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2347  GerE family regulatory protein  51.44 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.925531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1047  LuxR family DNA-binding response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1132  LuxR family DNA-binding response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0853  LuxR family DNA-binding response regulator  50.96 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1818  LuxR family DNA-binding response regulator  50.96 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  63.53 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 210 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  48.33 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 210 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 210 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 236 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1634  LuxR family DNA-binding response regulator  49.52 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 239 aa  184  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  45.45 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  45.93 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.51 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.54 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5766  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.918691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 455 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  43.54 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>