More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1588 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 208 aa  231  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 455 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  54.33 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.4 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 271 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  49.04 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 210 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 236 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 209 aa  197  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 210 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 210 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  43.54 
 
 		 214 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 282 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  44.23 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  43.75 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.63 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 215 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  44.93 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  44.23 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  42.31 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  42.79 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  44.93 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.89 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>