More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1664 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 223 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.42 
 
 		 216 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 264 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  45.37 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  42.66 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  44.81 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 219 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  41.43 
 
 		 215 aa  171  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  40.67 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  40 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  40.19 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.14 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.12 
 
 		 228 aa  162  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  37.91 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  36.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  36.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  161  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  39.72 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 218 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0671  putative response regulator  36.21 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.248332  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>