More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1700 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  51.63 
 
 		 232 aa  222  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.63 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 213 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  38.68 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  38.5 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  41.36 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.21 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5199  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  34.88 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  41.15 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  34.12 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  33.49 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.27 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  34.43 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  34.43 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  34.43 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  34.43 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  33.8 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  36.41 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  33.96 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  33.96 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  33.96 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  33.82 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  33.65 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  38.86 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.4 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  31.75 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  33.65 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.1 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>