More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0977 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 218 aa  251  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.81 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  47.22 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  43.87 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1129  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  36.57 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  40.76 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  43.06 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  42.18 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.28 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.09 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 229 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.52 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.98 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  37.95 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  40.48 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.23 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.1 
 
 		 234 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  37.32 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  37.05 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>