More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1293 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.67 
 
 		 216 aa  245  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.49 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  55.4 
 
 		 215 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  51.6 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  41.12 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  39.34 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  40.48 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  42.65 
 
 		 206 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 213 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 1648 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  38.25 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  40.67 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.53 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.47 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  39.23 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1239  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0482404  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>