More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1311 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  46.51 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  43.27 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.02 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.98 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  46.6 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  46.6 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1435  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.99 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  38.39 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  36.19 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  40.85 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  39.53 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.83 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  41 
 
 		 218 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.5 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>