More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4229 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  74.52 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  63.05 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  53 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  52.07 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  53.62 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.22 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.8 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  49.29 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  45.62 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  38.94 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 219 aa  160  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  39.3 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  41.38 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  48.51 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  37.81 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  40.28 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  33.95 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  35.92 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  33.18 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  37.98 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  43 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  35.12 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  37.95 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  41.51 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  41.51 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.02 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  39.9 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.5 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>