More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5409 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.27 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 218 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  41.52 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.27 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  36.82 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 219 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  36.82 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 214 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  38.53 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.82 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  38.36 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  34.39 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.53 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  36.11 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.75 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 210 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  35.32 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.32 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  35 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  34.23 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 211 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2735  response regulator receiver  37.61 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0572845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>