More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0700 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  45.91 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  39.81 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.61 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1873  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  35.94 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2299  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  35.78 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1646  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  37.38 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  36.41 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  35.02 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  35.32 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  37.38 
 
 		 231 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1233  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.792953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1266  two-component response regulator  35.38 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847879  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.27 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>