More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3828 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 220 aa  446  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  75 
 
 		 221 aa  334  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.11 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  53.05 
 
 		 216 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  49.27 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  46.7 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.57 
 
 		 219 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  41.75 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  45.24 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  38.1 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.54 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  37.44 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  36.54 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  36.54 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  45.15 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.97 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.97 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  34.91 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35.24 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.49 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.49 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.49 
 
 		 218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  38.76 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 215 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  34.76 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.09 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  36.89 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  35.75 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  34.76 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  37.27 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  37.56 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.05 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>