More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3303 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  42.71 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  39.41 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 205 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 215 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.08 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  36.15 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.61 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  39.11 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.09 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 212 aa  141  9e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  46.08 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  39.6 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 220 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  134  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  36.06 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  35.1 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  32.69 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  34.48 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  34.48 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  33 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  35.1 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  35.94 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  33.99 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  43.63 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  36.95 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  34.48 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  37.13 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  33.5 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  35.24 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  33.5 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  33 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  34.62 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  33.99 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3615  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378192  normal  0.274637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  33.99 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  33.82 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  32.02 
 
 		 218 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1667  two component LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.869411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  33.33 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  31.13 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  33.99 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  34.78 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  33.66 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  33 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  37.02 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  32.84 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  32.84 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>