More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0816 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  46.12 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 215 aa  188  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.75 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 232 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  37.56 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  42.65 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  38.05 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.89 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  38.05 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  36.59 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  36.45 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  34.3 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  36.59 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  35.96 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  37.68 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  36.59 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  36.59 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  36.59 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  35.96 
 
 		 229 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.06 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.06 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.06 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.06 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35.61 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.61 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.25 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  36.1 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  35.47 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  39.22 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  35.12 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.06 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  37.02 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000268807  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 213 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35.12 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  36.27 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  37.91 
 
 		 282 aa  141  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 222 aa  141  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.49 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>