More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6075 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.48 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.05 
 
 		 220 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.4 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  49.52 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  50.73 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.83 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.77 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  52.36 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  49.76 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  36.71 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  37.5 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  37.62 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.95 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.54 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.44 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.36 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  35.58 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 212 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  34.93 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  36.67 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.1 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  36.23 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  34.62 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  36.23 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  35.12 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  36.1 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.24 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  34.13 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  39.81 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  34.13 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  34.13 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.07 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  35.32 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  36.89 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  37.32 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  35.27 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>