More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3597 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  48.13 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  43.06 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  45.15 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.44 
 
 		 223 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  40.67 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  43.75 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  42.51 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  35.89 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.96 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  36.84 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  36.36 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  38.28 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  36.97 
 
 		 216 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  34.93 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  38.94 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  36.19 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  36.19 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  34.29 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.32 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  37.14 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>