More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2471 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  47.6 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  45.97 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  49.03 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 222 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  45.63 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.26 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 211 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  43.69 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  37.44 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  37.91 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  39.15 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  38.21 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  39.22 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  37.98 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  41.06 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.54 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  38.03 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.85 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  39.15 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  44.19 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.91 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.54 
 
 		 214 aa  147  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  37.5 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  41.26 
 
 		 215 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  36.54 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  36.36 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.65 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 208 aa  141  9e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  42.45 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.34 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  36.63 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  41.63 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  36.63 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  39.32 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  45.79 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  37.31 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>