More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3594 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  97.72 
 
 		 220 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  87.21 
 
 		 219 aa  348  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  82.55 
 
 		 219 aa  330  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.05 
 
 		 219 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.08 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.88 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  53.77 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  54.15 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  44.39 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  41.55 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  42.51 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  43.33 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.85 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.85 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.85 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  40 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  34.91 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  34.91 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  34.91 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  34.91 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  34.62 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  34.91 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.68 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  34.74 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  34.6 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.31 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  34.6 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  34.45 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  36.36 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  35.21 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  32.7 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  40.28 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  35.78 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  34.8 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  35.29 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  35.92 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  33.49 
 
 		 214 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  34.31 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 213 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  36.62 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  33.81 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  33.97 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  32.39 
 
 		 219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2990  two component LuxR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  33.65 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  31.28 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  32.39 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  33.18 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  39.63 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  39.72 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>