More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5350 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.63 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  49.76 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.15 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  53.17 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  45.63 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  42.38 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  40.18 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  38.76 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  37.32 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  38.1 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  37.62 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  37.62 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  37.62 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  37.62 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  37.62 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  37.8 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  37.8 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  38.57 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  36.67 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  36.36 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  36.36 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  36.36 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  37.21 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  36.84 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.56 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  35.89 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  36.95 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.89 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  36.84 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  36.95 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  38.83 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  38.1 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  35.71 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  35.71 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  38.68 
 
 		 282 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  36.54 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 214 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>