More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5446 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.02 
 
 		 219 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.65 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.08 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 219 aa  234  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  63.11 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.07 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  53.4 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  57.28 
 
 		 215 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  48.56 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  45.07 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 213 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  45.15 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  38.57 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  38.1 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  37.62 
 
 		 214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  39.05 
 
 		 218 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  37.74 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  38.28 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  38.57 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  38.1 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  37.98 
 
 		 218 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  38.68 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  37.98 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  37.98 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  37.68 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  42.51 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36.36 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  38.57 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  38.57 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  36.32 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.62 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  38.39 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.49 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  35.89 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  37.98 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  37.02 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  36.06 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  37.2 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  36.84 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  36.84 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  34.62 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  34.62 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 206 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  36.32 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  36.02 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  36.32 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.56 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  38.5 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>