More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0357 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.27 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  50.73 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.56 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  47.34 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  44.08 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.41 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  45.89 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  45.63 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 232 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  36.14 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  41.83 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.15 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  37.98 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  35.15 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  44.23 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  36.27 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  35.15 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  35.64 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.58 
 
 		 214 aa  141  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.23 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  34.13 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  38.94 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  37.5 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  33.65 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35.75 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35.75 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.41 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.27 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.27 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.27 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  34.62 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  32.69 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>