More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7263 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7263  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  77.36 
 
 		 219 aa  315  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3468  two component transcriptional regulator, LuxR family  78.47 
 
 		 219 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3270  response regulator receiver  78.77 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3594  two component transcriptional regulator, LuxR family  79.05 
 
 		 219 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.02 
 
 		 218 aa  265  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.76 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  55.83 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.57 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  46.41 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5350  two-component response regulator  53.85 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  43.48 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0478  two-component response regulator  43.75 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0760202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  40.28 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  37.2 
 
 		 218 aa  134  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  37.02 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  37.02 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.71 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.71 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.71 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  34.93 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  42.59 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  33.98 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  33.65 
 
 		 216 aa  128  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  34.95 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  35.58 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1904  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0420846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  33.5 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  33.83 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  35.32 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  33.01 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  34.62 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  34.95 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 216 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  32.85 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  41.67 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  31.9 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  34.33 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  33.83 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.9 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  33.17 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.32 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.3 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>