More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0555 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.41 
 
 		 224 aa  254  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  52.09 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  52.09 
 
 		 224 aa  231  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.09 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  48.1 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  54.07 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.07 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  48.34 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.4 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  47.96 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.9 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  48.1 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.07 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 207 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45 
 
 		 226 aa  184  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  48.13 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  44.6 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.25 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0759  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 218 aa  181  7e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  50 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 253 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.09 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 213 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.58 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.25 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.41 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.63 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.06 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  47.14 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.75 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  44.44 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  44.44 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.39 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  44.64 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  42.66 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  44.88 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.54 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  44.88 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>