More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4744 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  100 
 
 		 209 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.43 
 
 		 211 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  53.92 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.39 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.33 
 
 		 210 aa  204  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.49 
 
 		 216 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  57.07 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.37 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.1 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  51.2 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.61 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  48.86 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.48 
 
 		 234 aa  184  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.55 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.92 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.96 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.2 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.21 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.37 
 
 		 213 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  47.83 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.66 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.51 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.07 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.36 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.95 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.83 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  49.76 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.93 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 223 aa  164  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  42.23 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.24 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.15 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  44.08 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  43.6 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 253 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  43.4 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 224 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 221 aa  160  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  45.85 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 209 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.55 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 232 aa  158  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>