More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3811 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 206 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  68.93 
 
 		 207 aa  275  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.29 
 
 		 222 aa  215  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.71 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  53.66 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.18 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  50.48 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.63 
 
 		 211 aa  187  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  51.4 
 
 		 218 aa  187  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.48 
 
 		 211 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.53 
 
 		 222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.28 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.73 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.14 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  50.24 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  48.78 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.2 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.09 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  46.83 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 209 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.98 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  50 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  38.86 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.36 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.29 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.98 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  40.58 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  41.31 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  40.78 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2190  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.72 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000643495  hitchhiker  0.000215707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 213 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  41.35 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.24 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  37.38 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6161  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902987  decreased coverage  0.000109123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.29 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  39.7 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.01 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  42.56 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  141  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.36 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  33.64 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  40.87 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 303 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  38.32 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  38.5 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>